Balai Pelatihan Kesehatan (Bapelkes) Batam dalam melaksanakan tugas dan fungsinya di bidang pendidikan dan pelatihan didukung oleh sarana dan prasarana yang memadai. Bapelkes Batam memiliki tiga (3) gedung, yaitu Gedung Aceh, Gedung Sumut dan Gedung Riau. Bapelkes Batam sendiri beralamatkan di Jalan Marina City Kel. Tanjung Riau Kec. Batu Aji Kota Batam. Sarana dan prasarana yang berupa Asrama, Ruang Diskusi, Ruang Kelas, Auditorium, Lab Skill, Lab Prilaku, Lab Bahasa, Lab Komputer, Perpustakaan serta Penunjang Pelatihan Lainnya tersebut bertujuan untuk memperlancar pencapaian visi misi Bapelkes Batam sebagai salah satu instansi penyelenggara Diklat Nasional di Indonesia.